A. B. Mutiara

Universitas Gunadarma Staff Blog

Ilmu Komputer, Informasi, dan Fisika

Andrea Montanari & Marc Mézard telah menulis sebuah buku: Information, Physics and Computation. Buku yang unik dan meng-cover interseksi yang menarik antara Statistical Physics,  Theoretical Computer Science, Discrete Mathematics, Information Theory, dan Coding Theory.

parity check code & factor graph (small)

[ graphs courtesy of Montanari & Mézard ]

Bukunya baru2 ini telah dipublikasikan. Harapannya, PDF files akan terus tersedia secara online. Jika kita pernah baca buku David MacKay’s gorgeous( book ),  maka kita kemungkinan akan suka juga buku Montanari.

Level Set Method’s References

Level Set Methods and Dynamic Implicit Surfaces
by: Stanley J. Osher, Ronald P. Fedkiw
Springer

Geometric Level Set Methods in Imaging, Vision, and Graphics
by: Stanley Osher (Editor), Nikos Paragios (Editor)


Level Set Methods and Fast Marching Methods: Evolving Interfaces in Computational Geometry, Fluid Mechanics, Computer Vision, and Materials Science 2nd Edition (Cambridge … on Applied and Computational Mathematics)
by: J. A. Sethian

Surface Evolution Equations: A Level Set Approach (Monographs in Mathematics)
by: Yoshikazu Giga

Level Set Methods: Evolving Interfaces in Geometry, Fluid Mechanics, Computer Vision, and Materials Science (Cambridge Monographs on Applied and Computational Mathematics 3)

by: J. A. Sethian

Cambridge University Press

International Journal of Computer Vision (Volumes 21-73 = years 1997-2007)
by: K. Ikeuchi, J. Ponce
Springer

PDE and Level Sets: Algorithmic Approaches to Static and Motion Imagery (Topics in Biomedical Engineering)

Level Set Method

Level set method (LSM)  merupakan suatu teknik numerik untuk men-tracking permukaan dan bentuk. Keuntungan LSM adalah kita dapat melakukan komputasi numerik yang melibatkan kurva2 dan permukaan2 pada grid kartesian tanpa harus memparameterisasi obyek2 tersebut (hal biasa kita sebut  Eulerian approach). Di samping itu, LSM sangat mempermudah kita untuk mengikuti bentuk2 yang berubah topologinya. Contoh2 misalkan sebuah bentuk membelah menjadu dua, pengembangan lubang/gua, atau operasi kebalikannya.

LSM dikembangkan sekitar tahun 80-an oleh “American mathematicians” Stanley Osher dan James Sethian. Dan sudah diterapkan pada berbagai bidang seperti image processing, computer graphics, computational geometry, optimization, and computational fluid dynamics.

Prof. Ronald Fedkiw telah menerapkan dalam film-film fiksi holywood: Star Wars, Harry Potter, Terminator, and Pirates of the Caribbean franchises. Melalui penerapan LSM dalam film fiksi, Fedkiw dianugerahi  80th Academy Awards National Academy for Science.

Mudah2an metode ini menjadi tema2 PI dan skripsi mahasiswa kita.

Memang sudah kewajiban seorang dosen untuk membuat catatan kuliah. Semester ini kebetulan mengajar JST, beberapa catatan kuliah untuk 7 pertemuan (yang  cukup sederhana bagi pemula) sudah saya upload di staff-site saya. (Sumber: 1)  fundamental of NN dari Laueren Fausette dan 2) JST dan pemrograman MATLAB, JJ  Siang). Bagi yang tertarik silahkan download di http://amutiara.staff.gunadarma.ac.id/

Yang up-to-date dengan tanda “b”, misal ada kuliah 4a dan kuliah 4b, maka sebaiknya di download yang kuliah 4b.

Mohon komentar…….

  • 0 Comments
  • Filed under: AI, JST
  • Anastasia Dwi Astuti, 50405068

    Kata Kunci : dinamika molekuler, Gromacs, Linux, pymol, grace, kimia

    (xiv + 81 + Lampiran)

    Perkembangan teknologi komputer dalam bidang kimia memunculkan banyak aplikasi kimia. Tidak hanya aplikasi untuk memvisualisasikan struktur molekul tapi juga untuk simulasi dinamika molekuler. Salah satunya adalah Gromacs. Gromacs merupakan contoh aplikasi dinamika molekuler yang dikembangkan oleh universitas Groningen. Aplikasi ini bersifat non-komersial dan mampu bekerja dalam sistem operasi Linux. Kemampuan utama Gromacs adalah melakukan simulasi dinamika molekuler serta penyusutan energi.

    Dalam penulisan ini, penulis membahas mengenai bagaimana cara kerja Gromacs dalam simulasi dinamika molekuler beberapa protein. Dalam melakukan simulasi dinamika molekuler, Gromacs tidak bekerja sendiri. Gromacs berinteraksi dengan aplikasi Pymol serta aplikasi Grace. Pymol merupakan aplikasi untuk menvisualisasikan hasil simulasi sedangkan Grace merupakan aplikasi dalam linux untuk menampilkan grafik. Kedua aplikasi ini mendukung dalam hal analisis hasil simulasi dinamika molekuler dengan Gromacs.

    download file pdf

    Cannot create QuickStats table. Database user does not have CREATE priviledge.